Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYX4

CALY, Neuron-specific vesicular protein calcyon, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALYQ9NYX4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CALYQ9NYX4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms