Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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