Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMTM6Q9NX76 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms