Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSDC1Q9NW68 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSDC1Q9NW68 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms