Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSG2

C1orf112, Uncharacterized protein C1orf112, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf112Q9NSG2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf112Q9NSG2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms