Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.847e-27■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 37.33□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.442e-13■■■■■ 177
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-222ENST00000575909 708 ntTSL 310.56□□□□□ -0.725e-13■■■■■ 176.9
UTP3Q9NQZ2 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 176.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 176.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 176.7
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-210ENST00000543358 659 ntTSL 320.78■□□□□ 0.924e-9■■■■■ 176.7
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 176.7
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-210ENST00000559001 2403 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 176.7
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-201ENST00000403058 2335 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.814e-9■■■■■ 176.7
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 516.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 176.6
UTP3Q9NQZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.73e-7■■■■■ 176.5
UTP3Q9NQZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 176.5
UTP3Q9NQZ2 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.35e-8■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-204ENST00000517510 2016 ntTSL 513.71□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-212ENST00000519646 2587 ntTSL 512.66□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-221ENST00000521613 1903 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-215ENST00000520015 1931 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-226ENST00000522889 567 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-207ENST00000518596 1047 ntTSL 211.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-203ENST00000447740 5210 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-205ENST00000517778 620 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-220ENST00000521437 579 ntTSL 410.97□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-213ENST00000519940 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-223ENST00000522068 573 ntTSL 410.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-222ENST00000522051 4680 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-208ENST00000518622 5233 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-225ENST00000522773 2884 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-218ENST00000521092 555 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-210ENST00000519302 751 ntTSL 38.73□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-209ENST00000518979 3533 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 FER-204ENST00000504143 3132 ntTSL 54.98□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 176.3
UTP3Q9NQZ2 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 176.2
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-206ENST00000542306 1246 ntTSL 521.62■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 176.1
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 176.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-209ENST00000423127 798 ntTSL 510.45□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 176
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 516.99■□□□□ 0.318e-8■■■■■ 176
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 512.86□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 176
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 512.36□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 176
UTP3Q9NQZ2 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 176
UTP3Q9NQZ2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 175.9
UTP3Q9NQZ2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 175.9
UTP3Q9NQZ2 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.421e-9■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 06e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-209ENST00000447986 1632 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.216e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-211ENST00000461043 728 ntTSL 212.96□□□□□ -0.336e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-205ENST00000413587 977 ntTSL 512.89□□□□□ -0.356e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.396e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 512.03□□□□□ -0.486e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 ERGIC3-219ENST00000496172 781 ntTSL 211.12□□□□□ -0.636e-11■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 410.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFAF2-202ENST00000502658 461 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 175.8
UTP3Q9NQZ2 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 175.7
UTP3Q9NQZ2 PAXBP1-206ENST00000464256 1692 ntTSL 1 (best)27.32■■□□□ 1.961e-6■■■■■ 175.5
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 175.4
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 175.4
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.425e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-214ENST00000531217 1745 ntTSL 522.39■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.339e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 TBCD-222ENST00000576677 1926 ntTSL 1 (best)23.75■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 TBCD-221ENST00000576603 765 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 TBCD-218ENST00000575132 707 ntTSL 515.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 TBCD-226ENST00000577051 979 ntTSL 515.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 59.69□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 510.74□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 175.1
UTP3Q9NQZ2 DHX16-203ENST00000415603 892 ntTSL 318.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 175
UTP3Q9NQZ2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 175
UTP3Q9NQZ2 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 514.43□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 513.88□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 211.36□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 174.9
UTP3Q9NQZ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.994e-8■■■■■ 174.9
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