Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC31BQ9NQW1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms