Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCM1Q9NP62 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms