Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms