Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KIAA1549Q9HCM3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms