Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELL3Q9HB65 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELL3Q9HB65 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms