Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRCC1Q9C099 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms