Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms