Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms