Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms