Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATA5Q9BWX5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms