Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL6Q9BWW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms