Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC32Q9BV29 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC32Q9BV29 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms