Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRACR2AQ9BSW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms