Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TINF2Q9BSI4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms