Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms