Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms