Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS6KC1Q96S38 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms