Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMKK2Q96RR4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMKK2Q96RR4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms