Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMG1Q96Q15 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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