Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR78Q96P69 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms