Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRP3Q96P20 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP3Q96P20 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms