Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms