Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms