Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EP400Q96L91 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms