Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS50Q96JG6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms