Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms