Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms