Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTERF3Q96E29 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTERF3Q96E29 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms