Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms