Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms