Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms