Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSLPQ969D9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms