Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms