Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms