Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC82Q8N4S0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC82Q8N4S0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms