Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMTM1Q8IZ96 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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