Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF550Q7Z398 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms