Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP50Q70EL3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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