Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
WDR88Q6ZMY6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms