Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C12orf54Q6X4T0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms