Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A10Q6U841 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms