Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL35Q6PF15 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms