Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6P435 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6P435 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6P435 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms