Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP5Q6NZY7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms